Tetapi ada masalah utama lainnya, di mana pemberontak sering melakukan penggeledahan terhadap kendaraan yang meninggalkan Timbuktu, dan jika mereka menemukan naskah kuno itu maka akan disita dan dihancurkan.
"Itu sangat beresiko. Kami mengevakuasi manuskrip dengan mobil, gerobak dan kano,'' kata Haidara, yang menggelar operasi penyelamatan ini di bulan Oktober dengan menyembunyikan kotak besi penyimpan naskah kuno di bawah sayur-sayuran dan buah-buahan.
"Satu mobil hanya bisa membawa dua atau tiga kotak. Jadi kami melakukannya sedikit demi sedikit.''
Mobil kemudian menuju Bamako, melalui Mopti - kota terakhir Mali yang dikontrol pemerintah saat pemberontak Islamis menguasai kawasan utara.
Sementara dokumen yang diselundupkan dengan kano - bagian dari transportasi lokal di Mali utara selama berabad-abad - berjalan ke Bamako melalui sungai Niger, melalui Djenne.
Ketika para pemberontak membakar perpustakaan milik Institut Ahmed Baba Januari awal tahun ini, operasi penyelamatan telah berlangsung separuh jalan - dan perpustakaan itu sendiri telah dikosongkan selama berbulan-bulan.
Haidara memperkirakan hanya sedikit naskah kuno yang berhasil dihancurkan.
Masalah iklim
Saat situasi di utara masih bergejolak, bagaimanapun, operasi penyelamatan masih berlanjut selama tiga bulan setelah penarikan pemberontak, sampai 2.400 kotak besi berisi sekitar 285.000 naskah kuno telah terkirim ke rumah-rumah pribadi di ibukota.
Namun, di Bamako, dokumen tersebut masih menghadapi ancaman lainnya.
Dokumen yang diawetkan selama berabad-abad oleh iklim gurun kering tersebut berikutnya harus menghadapi cuaca tropik, dengan musim hujan segera datang.
"Rumah penyimpan tidak memiliki penyejuk udara dan kelembaban di Bamako lebih tinggi dari Timbuktu,'' kata Dr Michael Hanssler dari Yayasan Gerda Henkel Foundation.