Artefak-artefak yang ditemukan di situs kapal karam di antaranya adalah piringan campuran tembaga yang bertanda mantel lengan kerajaan Portugis, lonceng perunggu dengan prasasti “498” yang menunjukkan bahwa kapal tersebut dibangun pada tahun 1948, koin emas yang dicetak di Lisbon antara 1495 dan 1501 dan koin perak langka yang disebut Indio, digunakan pada 1499 khusus untuk perdagangan dengan India.
“Koin perak Indio betul-betul langka, karena sejauh ini baru ditemukan dua koin serupa, Fakta bahwa koin tersebut digunakan khusus untuk perdagangan Portugis di India dengan sendirinya menjadi indikator kuat kebangsaan kapal.
Dia mencatat ada korelasi geografis yang jelas antara situs dan catatan sejarah dari hilangnya kapal yang dikuasai oleh Sodré.
Meskipun catatan sejarah menunjukkan bahwa reruntuhan kapal berasal dari Esmeralda dan bukan São Pedro, para peneliti mengakui bukti konklusif masih hilang.
Salah satu petunjuk penting berasal dari 35 batu bola meriam yang diukir dengan huruf VS, yang kemungkinan merupakan merupakan inisial dari Vincente Sodré, komandan Esmeralda.