Nationalgeographic.co.id - Sebuah tim ilmuwan internasional telah mengidentifikasi antibodi yang menetralkan omicron dan varian SARS-CoV-2 lainnya. Antibodi ini menargetkan area protein spike virus yang pada dasarnya tetap tidak berubah saat virus bermutasi.
Dengan mengidentifikasi target antibodi “penetralisir luas” ini pada protein spike, dimungkinkan untuk merancang vaksin dan perawatan antibodi yang akan efektif terhadap tidak hanya varian omicron saja tetapi varian lain yang mungkin muncul di masa depan, kata David Veesler, penyelidik dengan Institut Medis Howard Hughes dan profesor biokimia di Fakultas Kedokteran University of Washington di Seattle.
“Temuan ini memberi tahu kita bahwa dengan berfokus pada antibodi yang menargetkan situs yang sangat terkonservasi pada protein spike, ada cara untuk mengatasi evolusi berkelanjutan virus,” tutur Veesler, seperti yang dilaporkan Tech Explorist.
Veesler memimpin proyek penelitian dengan Davide Corti dari Humabs Biomed SA, Vir Biotechnology, di Swiss. Temuan penelitian ini telah diterbitkan pada 23 Desember 2021 di jurnal Nature dengan menuliskan judul Broadly neutralizing antibodies overcome SARS-CoV-2 Omicron antigenic shift. Penulis utama penelitian ini adalah Elisabetta Cameroni dan Christian Saliba (Humabs), John E. Bowen (UW Biochesmistry), dan Laura Rosen (Vir).
Varian omicron memiliki 37 mutasi pada protein spike, yang digunakan untuk menempel dan menyerang sel. Ini adalah jumlah mutasi yang luar biasa tinggi. Diperkirakan bahwa perubahan ini menjelaskan sebagian mengapa varian tersebut dapat menyebar begitu cepat, menginfeksi orang yang telah divaksinasi dan menginfeksi kembali mereka yang sebelumnya telah terinfeksi.
“Pertanyaan utama yang kami coba jawab adalah: bagaimana konstelasi mutasi pada protein spike varian omicron ini memengaruhi kemampuannya untuk mengikat sel dan menghindari respons antibodi sistem kekebalan,” kata Veesler.
Baca Juga: Varian Omicron Ditemukan di Luar Afrika, Apa yang Ilmuwan Ketahui?
Veesler dan rekan-rekannya berspekulasi bahwa sejumlah besar mutasi omicron mungkin telah terakumulasi selama infeksi berkepanjangan pada seseorang dengan sistem kekebalan yang lemah atau oleh virus yang melompat dari manusia ke spesies hewan dan kembali lagi.
Untuk menilai efek dari mutasi ini, para peneliti merekayasa virus non-replikasi yang dinonaktifkan, yang disebut pseudovirus, untuk menghasilkan protein spike di permukaannya, seperti yang dilakukan virus corona. Mereka kemudian menciptakan pseudovirus yang memiliki protein spike dengan mutasi omicron dan yang ditemukan pada varian paling awal yang diidentifikasi dalam pandemi.
Para peneliti pertama-tama melihat seberapa baik versi berbeda dari protein spike mampu mengikat protein pada permukaan sel, yang digunakan virus untuk menempel dan memasuki sel. Protein ini disebut reseptor angiotensin converting enzyme-2 (ACE2).
Mereka menemukan bahwa protein spike varian omicron ini mampu mengikat 2,4 kali lebih baik daripada protein lonjakan yang ditemukan pada virus yang diisolasi pada awal pandemi. “Itu bukan peningkatan yang besar,” kata Veesler, “tetapi dalam wabah SARS pada 2002-2003, mutasi pada protein spike yang meningkatkan afinitas dikaitkan dengan transmisibilitas dan infektivitas yang lebih tinggi,” tuturnya.