Sebanyak tujuh endocast virtual dari tempurung otak Shuyu kemudian direkonstruksi. Hampir semua detail anatomi tengkorak Shuyu terungkap dalam tengkorak seukuran kuku jarinya, termasuk lima divisi otak, organ sensorik, dan saraf kranial juga saluran pembuluh darah di tengkorak.
"Banyak struktur penting manusia dapat ditelusuri kembali ke nenek moyang ikan kita, seperti gigi, rahang, telinga tengah, dll. Tugas utama ahli paleontologi adalah menemukan mata rantai penting yang hilang dalam rantai evolusi dari ikan hingga manusia. Shuyu telah dianggap sebagai mata rantai kunci yang hilang sama pentingnya dengan Archaeopteryx, Ichthyostega, dan Tiktaalik," kata Zhu Min, akademisi dari Chinese Academy of Sciences.
Spirakel adalah lubang kecil di belakang setiap mata yang membuka ke mulut pada beberapa ikan. Pada hiu dan semua pari, spirakel bertanggung jawab untuk memasukkan air ke dalam ruang bukal sebelum dikeluarkan dari insang. Spirakel sering terletak di bagian atas hewan yang memungkinkan bernapas bahkan saat hewan tersebut sebagian besar terkubur di bawah sedimen.
Di Polypterus, ikan bertulang yang paling primitif dan hidup ini, spirakel digunakan untuk menghirup udara. Namun, spirakel ikan akhirnya diganti di sebagian besar spesies non-ikan saat mereka berevolusi untuk bernapas melalui hidung dan mulut mereka. Pada tetrapoda awal, spirakel tampaknya telah berkembang pertama kali menjadi takik Otic. Seperti spirakel, itu digunakan dalam respirasi dan tidak mampu merasakan suara. Kemudian spirakel berevolusi menjadi telinga tetrapoda modern, akhirnya menjadi saluran pendengaran yang digunakan untuk mentransmisikan suara ke otak melalui tulang telinga bagian dalam yang kecil. Fungsi ini tetap ada sepanjang evolusi manusia.
"Temuan kami menjembatani seluruh sejarah celah spirakular, menyatukan penemuan terbaru dari kantong insang fosil vertebrata tanpa rahang, melalui spirakel vertebrata berahang paling awal, ke telinga tengah tetrapoda pertama yang menceritakan kisah evolusi luar biasa ini," kata Prof. Per E. Ahlberg dari Uppsala University dan akademisi dari Royal Swedish Academy of Sciences.