Dunia Hewan: Ilmuwan Mengurutkan DNA 2 Hiu yang Terancam Punah

By Ricky Jenihansen, Senin, 9 Januari 2023 | 17:00 WIB
Hiu martil besar (Sphyrna mokarran). (Christopher Vaughn-Jones)

 Nationalgeographic.co.id - Para ilmuwan telah mengurutkan DNA 2 hiu yang terancam punah yaitu, hiu martil besar (Sphyrna mokarran) dan hiu mako sirip pendek (Isurus oxyrinchus). Kedua hiu itu terancam punah dan telah mengalami penurunan drastis dalam ukuran populasi efektif selama 250.000 tahun terakhir, menurut studi baru.

Rincian penelitian tersebut telah dipublikasikan di jurnal iScience baru-baru ini dengan judul "Genomes of endangered great hammerhead and shortfin mako sharks reveal historic population declines and high levels of inbreeding in great hammerhead."

Dijelaskan, kelas Chondrichthyes (hiu, pari, dan chimera) memiliki sejarah sekitar 420 juta tahun yang telah bertahan lima kali dari kepunahan massal, tapi sekarang terancam.

Hari ini garis keturunan kuno ini menemukan dirinya dalam zaman geologis baru, Antroposen, yang mungkin dicirikan sebagai kepunahan massal keenam.

Dalam laporan baru-baru ini oleh IUCN Red List of Threatened Species, 31% dari semua spesies hiu terancam, angka yang jauh lebih tinggi dari perkiraan tahun 2014. Dari spesies hiu yang terancam ini, 6,5% sangat terancam punah dan 10,5% terancam punah.

Laporan lain baru-baru ini menunjukkan kelimpahan global hiu dan pari samudera telah menurun sebesar 71%, karena peningkatan tekanan penangkapan ikan relatif 18 kali lipat.

Pada tahun 1980, hanya 9 spesies hiu dan pari samudera yang terancam dalam kategori Daftar Merah IUCN, tetapi pada tahun 2021, 75% dari spesies tersebut sekarang terancam.

Hiu martil besar dan hiu mako sirip pendek adalah dua contoh penurunan dramatis baru-baru ini dalam kelompok ini.

Spesies ini tersebar di seluruh dunia, ditemukan di pesisir tropis dan laut beriklim hangat. Statusnya yang terancam punah terutama karena penangkapan ikan besar-besaran untuk siripnya yang besar, yang sangat dihargai dalam perdagangan sirip hiu.

Status terancam punah dari spesies ini terutama karena penangkapan ikan komersial dan olahraga memancing.

“Dengan seluruh genom mereka diuraikan dalam resolusi tinggi, kami memiliki jendela yang jauh lebih baik ke dalam sejarah evolusi spesies yang terancam punah ini,” kata Profesor Mahmood Shivji.

Hiu mako sirip pendek (Isurus oxyrinchus). (Simon Hilton)

Shivji adalah seorang peneliti di Nova Southeastern University dan direktur Pusat Penelitian Hiu Yayasan Save Our Seas.

Garis waktu DNA mereka menunjukkan bahwa populasi mereka telah menurun secara substansial selama 250.000 tahun.

Profesor Shivji dan rekannya memperoleh dan mengumpulkan seluruh sekuens genom untuk hiu martil besar dan hiu mako sirip pendek dan membandingkan genom mereka dengan informasi genom yang tersedia untuk hiu paus, hiu putih, hiu bambu berpita cokelat, dan hiu kucing.

Para penulis menemukan bahwa hiu martil besar memiliki kemungkinan besar mewarisi dua salinan dari urutan DNA yang sama (homozigositas), termasuk berbagai gen, dari orang tua mereka.

“Untuk memahami mengapa hal ini tidak diinginkan, Anda dapat memikirkannya dalam kaitannya dengan penyakit,” kata Profesor Shivji.

"Jika Anda homozigot untuk suatu sifat, Anda mewarisi urutan gen yang sama dari ibu dan ayah Anda, dan sifat itu akan diekspresikan."

Dalam kasus hiu martil besar, menunjukkan apa yang para ilmuwan juluki 'high run of homozygosity' dalam genom mereka berarti bahwa sebagian besar genom mereka adalah homozigot, meningkatkan kemungkinan mengekspresikan sifat yang tidak diinginkan.

Jika sifat yang tidak diinginkan bersifat resesif dalam keadaan heterozigot ini, sifat itu tidak akan diekspresikan.

Hiu mako sirip pendek memiliki tingkat homozigositas yang lebih rendah dibandingkan hiu martil besar, yang mungkin membuat mereka lebih mampu beradaptasi terhadap perubahan.

“Kemajuan teknis dalam studi genom menunjukkan bahwa pendekatan pengurutan DNA sekarang jauh lebih kuat dan efisien,” kata Michael Stanhope, peneliti di Cornell University.

Menurutnya, meskipun mereka tidak tahu persis efek perkawinan sedarah pada hiu, temuan dari serigala dan cheetah menunjukkan bahwa sifat bermasalah dapat merayap seiring waktu. Hasilnya sering menurunkan kelangsungan hidup spesies.

"Gambaran hiu martil besar, ditangkap secara berlebihan dan ditukar dengan siripnya, mengkhawatirkan," katanya.

“Tetapi tanpa wawasan genetik kritis ini, kami tidak akan dapat memodifikasi bagaimana populasi rentan mereka saat ini dikelola.”