Kecuali masjid, sekolah dasar, perpustakaan, dan madrasah saat ini digunakan sebagai klinik rawat jalan.
Masjid di Edirnekapı terdiri dari air mancur, madrasah, dan hammam. Tidak seperti namanya, faktanya masjid ini hanya memiliki satu menara.
Masjid mengalami kerusakan karena gempa bumi yang terjadi di tahun 1714, 1894 dan 1999. Penyair Turki Rıza Tevfik Bölükbaşı mengunjungi Masjid Sultan Mihrimah selama Perang Dunia I dan setelah melihatnya dalam reruntuhan, Iia menulis puisi yang menyayat hati.
Puisi tersebut, salah satu karya terbaik Bölükbaşı. Karyanya berhasil menyentuh hati banyak orang, yang berujung pada keputusan untuk merestorasi masjid.
Ketika Mihrimah Sultan meninggal di Istanbul pada tahun 1578, ia dimakamkan di permakaman ayahnya, bukan di salah satu masjid yang dibangunnya.