Perang Kemerdekaan Yunani dimulai pada 25 Maret 1821. Bouboulina sudah siap. Saat itu, ia adalah seorang wanita berusia 50 tahun dan komandan empat kapal selain 'Agamemnon'. Ia memimpin pasukan pribadi yang terdiri dari 'pemuda pemberani'. Mereka memanggilnya kapetanisa (nyonya kapten).
Segera setelah perang pecah, Bobboulina berlayar untuk menghadapi musuh Ottoman. Agamemmon adalah armada terbesar dan paling mengesankan di armada Yunani pada saat itu.
Dia memblokir pelabuhan di Nafplion, benteng strategis Kekaisaran Ottoman. Pada saat itu, Nafplion dianggap tidak dapat ditembus karena memiliki pertahanan yang kuat, termasuk 300 meriam. Bouboulina menunjukkan bahwa semua orang salah.
Sejarawan Yunani abad ke-19, Anargyros, Hatzi-Anargyrou, menulis laporan saksi mata tentang penyerangannya terhadap Nafplion.
Pada tanggal 4 Desember 1821, Bouboulina memberi perintah agar kapal-kapal tersebut menyerang benteng. Mereka segera berlayar ke depan, namun hujan peluru dan tembakan meriam dari benteng pantai membuat pemuda pemberani mundur sejenak.
Seperti Amazon yang marah, menyaksikan pertempuran di sisi perahunya, dia kemudian berteriak, “Apakah kalian perempuan dan bukan laki-laki? Maju!” Para petugasnya patuh, berkumpul kembali, dan menyerang.
Mereka bertempur tetapi mati sia-sia karena benteng tersebut tidak dapat ditembus melalui laut. Karena alasan ini, dia mendarat dengan pasukannya dan tinggal sampai jatuhnya benteng pada tanggal 30 November 1822. Bouboulina memimpin pasukannya dalam pertempuran, menghabiskan kekayaannya.
Setelah Nafplion, Bouboulina yang pemberani berpartisipasi dalam beberapa konfrontasi militer melawan Kekaisaran Ottoman. Insiden paling kritis terjadi pada bulan September 1821, setelah posisi Turki di Tripolis jatuh ke tangan pasukan Yunani yang mengepung. Kota ini jatuh setelah 3 hari pembantaian dan penjarahan, yang mengakibatkan 30.000 orang tewas.
Kematian Mendadak Komandan Pemberani Bouboulina
Bouboulina tidak mati seperti seorang prajurit pemberani dalam salah satu pertempuran untuk kebebasan Yunani. Pada akhir tahun 1824, selama perang dengan Kekaisaran Ottoman, terjadi perang saudara antara faksi-faksi pemberontak yang saling bertentangan. Mereka saling berseteru untuk menentukan kepemimpinan negara Yunani yang baru.
Bouboulina bukan hanya musuh Kekaisaran Ottoman, tapi dia juga punya satu musuh pribadi. Konon amarahnya yang berapi-api menyebabkan kematian pejuang wanita ini.
Pada tahun 1825 akibat perselisihan keluarga di Pulau Spetses, seseorang menembak Bouboulina. Dia terkena tembakan di bagian dahi dan tewas seketika. Pembunuh dalam insiden tragis ini tidak pernah teridentifikasi.
Dia menjadi miskin pada saat kematiannya; kekayaannya telah hilang dalam upayanya mencapai Kemerdekaan Yunani. Bouboulina bahkan kehilangan putra dan armadanya.
Sang pejuang wanita nan pemberani itu meninggal pada tanggal 22 Mei 1825. 5 tahun setelah kematiannya, pembentukan negara Yunani merdeka diakui oleh Eropa.
“Yunani memberi Bouboulina gelar kehormatan laksamana setelah kematiannya dan orang-orang Yunani terus mengenangnya,” tambah Sutherland.