Awalnya, Luther hanya ingin perdebatan terbuka tentang indulgensi dan pertobatan yang sejati. Namun, ketika tesisnya menjadi titik pertemuan bagi rakyat jelata yang menentang status quo dan dianut oleh Frederick III, Gereja berusaha membungkamnya.
Luther merespons dengan mempertanyakan seluruh hierarki, visi, dan legitimasi Gereja, yang mengakibatkan pertentangan yang mendalam. Roper memberikan komentarnya mengenai situasi ini.
Dengan menyerang pemahaman mengenai pertobatan, Luther secara implisit menyerang inti Gereja Katolik Roma dan seluruh struktur keuangannya.
"Gereja ini beroperasi dengan sistem keselamatan kolektif yang memungkinkan orang berdoa untuk yang lain dan mengurangi waktu mereka di purgatorium," katanya.
"Sistem ini mendanai para imam yang digaji untuk membacakan Misa ulang tahun bagi jiwa-jiwa yang telah meninggal. Sistem ini juga mendanai wanita-wanita awam yang tinggal di panti sosial dan berdoa bagi jiwa-jiwa yang telah meninggal, untuk meringankan perjalanan mereka melalui purgatorium."
"Selain itu, dana ini juga digunakan untuk kelompok-kelompok keagamaan yang berdoa bagi para anggotanya, membacakan Misa, mengadakan prosesi, dan mendanai altar-altar khusus. Singkatnya, sistem ini mengatur kehidupan keagamaan dan sosial bagi sebagian besar umat Kristen pada Abad Pertengahan."
"Di pusatnya terdapat Paus, yang menjadi pengelola "merit" atau anugerah yang dapat didistribusikan kepada yang lain. Oleh karena itu, menyerang indulgensi pada akhirnya akan membawa pada pertanyaan mengenai kekuasaan paus."
Inilah yang sebenarnya terjadi, dan peristiwa berlangsung cepat antara tahun 1518-1521, di mana Luther secara langsung menyerang otoritas paus dan diberi ekskomunikasi.
Pada Diet Worms tahun 1521, dia diminta untuk meratapi kesalahannya atau dianggap sebagai sesat dan diburu sebagai radikal.
Pidato Luther di Diet Worms, atau yang dikenal sebagai pidato "Here I Stand", menjelaskan posisinya dengan gemilang; dia bertahan pada pendiriannya.
Dia pasti akan ditangkap dan dieksekusi setelahnya. Akan tetapi, secara rahasia diberi perlindungan oleh Frederick III di kastilnya di Wartburg.