Puncaknya, pada 26 Juni, di pertandingan penentuan, El Salvador mengumumkan bahwa mereka memutuskan hubungan diplomatik dengan Honduras. Ini dilakukan karena Honduras tidak mengambil tindakan apa pun kepada warga yang telah melakukan kejahatan kepada para imigran Salvador.
Perselisihan di lapangan sepak bola itu berujung pada pecahnya perang di kemudian hari. Pada 14 Juli 1969, angkatan udara Salvador membom Honduras – termasuk bandara utama mereka. Dan di hari yang sama, angkatan darat juga menginvasi Honduras.
Baca juga: Mengapa Orang Zaman Dahulu Tidak Mau Tersenyum Ketika Difoto?
Pada hari berikutnya, orang-orang Salvador berhasil memasuki Honduras. Mereka menguasai sembilan kota dan berencana merebut ibu kota Honduras, Tegucigalpa.
Honduras, yang sudah kewalahan dan dalam keadaan terkepung, lalu meminta bantuan negara-negara Amerika. Akhirnya, gencatan senjata diberlakukan pada 18 Juli. Meski begitu, El Salvador baru menarik pasukan militernya keluar dari Honduras pada awal Agustus.
Perang selama empat hari itu menyebabkan 250 tentara dan 2000 penduduk Hoduras tewas. Begitu pula dengan El Salvador yang kehilangan 2000 penduduknya (klombinasi antara tentara dan warga sipil). Sekitar 130 ribu imigran Salvador di Honduras pun terpaksa kembali ke negara asal mereka.