Baca juga: Gianni Crea, Pemegang Kunci Bangunan-bangunan Bersejarah di Vatikan
Meskipun diakui sebagai Situs Warisan Dunia, tetapi kondisi Timbuktu memburuk dari waktu ke waktu. Pada 1990, ia bahkan termasuk warisan dunia yang terancam punah.
Dengan beberapa perbaikan dan pelestarian masjid kuno, Timbuktu kembali menempati posisinya di 2005. Namun, kota ini sulit menarik perhatian turis dan meningkatkan ekonomi pariwisatanya.
Pada 2012, lagi-lagi status Timbuktu sebagai warisan dunia terancam akibat konflik yang berlangsung.