Ilmuwan Temukan Gen yang Menggandakan Risiko Kematian Akibat COVID-19

By Wawan Setiawan, Selasa, 9 November 2021 | 13:00 WIB
Menggunakan algoritma AI, para ilmuwan menganalisis sejumlah besar data genetik dari ratusan jenis sel pada tubuh. (iStock/janiecbros)

Nationalgeographic.co.id—Para ilmuwan di Universitas Oxford telah mengidentifikasi gen yang bertanggung jawab dalam menggandakan risiko gagal pernapasan akibat COVID-19. Enam puluh persen orang dengan keturunan Asia Selatan membawa sinyal genetik berisiko tinggi, sebagian menjelaskan kelebihan kematian yang terlihat di beberapa komunitas Inggris, dan dampak COVID-19 di anak benua India.

Tahun 2021, adalah tahun terkelam dalam masa pandemi COVID-19, lebih dari 4,6 juta kasus kematian akibat pandemi ini telah dilaporkan terjadi di seluruh dunia.

Namun, sebuah studi baru yang dilakukan oleh para ilmuwan telah berhasil mengidentifikasi hamparan DNA pada kromosom 3 yang dapat menggandakan risiko orang dewasa di bawah 65 tahun meninggal akibat COVID-19. Akan tetapi, para ilmuwan belum mengetahui bagaimana sinyal genetik ini bekerja untuk meningkatkan risiko tersebut, atau perubahan genetik yang tepat yang bertanggung jawab.

Halaman berikutnya...

Dalam sebuah penelitian yang diterbitkan di Nature Genetics pada 04 November 2021 yang berjudul Identification of LZTFL1 as a candidate effector gene at a COVID-19 risk locus, tim peneliti yang dipimpin oleh Profesor James Davies dan Jim Hughes di MRC Weatherall Institute of Molecular Medicine Universitas Oxford menggunakan teknologi mutakhir untuk mengetahui gen mana yang menyebabkan efek tersebut, dan bagaimana hal itu bisa terjadi.

Mereka menemukan bahwa peningkatan risiko bukan karena perbedaan dalam pengkodean gen untuk protein, tetapi karena perbedaan dalam DNA yang membuat saklar untuk mengaktifkan gen.

Rekan pemimpin studi Jim Hughes, Profesor Regulasi Gen, mengatakan, "Alasan mengapa hal ini terbukti sangat sulit untuk diselesaikan, adalah bahwa sinyal genetik yang diidentifikasi sebelumnya memengaruhi "materi gelap" genom. Kami menemukan bahwa peningkatan risiko bukan karena perbedaan dalam pengkodean gen untuk protein, tetapi karena perbedaan dalam DNA yang membuat saklar untuk mengaktifkan gen. Jauh lebih sulit untuk mendeteksi gen yang dipengaruhi oleh efek peralihan tidak langsung semacam ini.”

Baca Juga: Vaksin Covid-19 Berbentuk Plester, Solusi untuk Fobia Jarum Suntik

Pertama kalinya seorang pasien diketahui terinfeksi dua varian virus corona yang berbeda. Pasien COVID-19 itu akhirnya meninggal. (RAW PIXEL LTD)

Dengan menggunakan algoritma AI, para ilmuwan menganalisis sejumlah besar data genetik dari ratusan jenis sel dari seluruh bagian tubuh. Mereka akhirnya menemukan bahwa sinyal genetik kemungkinan akan memengaruhi sel-sel di paru-paru.

Melansir Tech Explorist, Dr Damien Downes, yang memimpin pekerjaan laboratorium dari kelompok penelitian Hughes, mengatakan, "Anehnya, karena beberapa gen lain dicurigai, data menunjukkan bahwa gen yang relatif belum dipelajari yang disebut LZTFL1 menyebabkan efeknya."

Versi berisiko lebih tinggi dari gen LZTFL1 menghalangi sel-sel yang melapisi saluran udara dan paru-paru untuk merespons virus dengan tepat.Tetapi, itu tidak memengaruhi sistem kekebalan tubuh. Para ilmuwan mengharapkan orang yang membawa versi gen ini dapat merespon secara normal terhadap vaksin.

“Faktor genetik yang kami temukan menjelaskan mengapa beberapa orang mendapatkan sakit parah setelah infeksi virus corona. Ini menunjukkan bahwa bagaimana paru-paru merespons infeksi sangat penting. Ini penting karena sebagian besar perawatan berfokus pada mengubah cara sistem kekebalan bereaksi terhadap virus.” kata Profesor James Davies, rekan pemimpin studi, yang bekerja sebagai Konsultan NHS dalam Pengobatan Perawatan Intensif selama pandemi dan merupakan Associate Professor Genomics di Radcliffe Department of Medicine Oxford University.

Baca Juga: Imbas Covid-19, Penurunan Harapan Hidup Terbesar Sejak Perang Dunia II

Peningkatan risiko bukan karena perbedaan dalam pengkodean gen untuk protein, tetapi karena perbedaan dalam DNA. (Getty Images)

“Enam puluh persen orang dengan keturunan Asia Selatan membawa versi gen yang berisiko lebih tinggi ini dibandingkan dengan 15 persen dari mereka yang keturunan Eropa, ini menjelaskan sebagian tingkat kematian dan rawat inap yang lebih tinggi pada kelompok sebelumnya.” lapor para ilmuwan.

“Kode DNA berisiko lebih tinggi ditemukan lebih umum di beberapa komunitas etnis kulit hitam dan minoritas tetapi tidak di komunitas lain. Faktor sosial ekonomi juga mungkin penting dalam menjelaskan mengapa beberapa komunitas sangat terpengaruh oleh pandemi COVID-19.” ujar Davies.

“Meskipun kita tidak dapat mengubah genetika kita, hasil kami menunjukkan bahwa orang-orang dengan gen risiko lebih tinggi cenderung mendapat manfaat dari vaksinasi. Karena sinyal genetik memengaruhi paru-paru daripada sistem kekebalan, itu berarti peningkatan risiko harus dibatalkan oleh vaksin.” tegas Davies.

Para peneliti juga berharap bahwa obat-obatan dan terapi lain dapat menargetkan jalur yang mencegah lapisan paru-paru berubah menjadi sel yang kurang terspesialisasi, meningkatkan kemungkinan perawatan baru yang disesuaikan untuk mereka yang paling mungkin mengembangkan gejala parah.