Selama periode Jomon tengah, rumah-rumah juga menjadi lebih kompleks. Tempat tinggal berlantai lubang yang biasa mulai memiliki lantai yang dilapisi batu. Dinding dan atap kini dipisahkan sebagai bagian bangunan yang berbeda dan konstruksi menjadi lebih kompleks. Jerami dan alang-alang lainnya merupakan bahan konstruksi pilihan.
Periode Jomon akhir
Ciri mencolok dari periode Jomon akhir adalah rangkaian patung dogu kompleks yang menjadi umum. Patung dogu adalah sosok manusia dan hewan yang sangat bergaya, dihiasi dengan pola. Meskipun berasal dari Periode Jomon tengah, penggunaannya terus berlanjut hingga Periode Jomon akhir.
Patung-patung dogu diteorikan sebagai representasi dewa dan digunakan untuk tujuan sihir. Teori ini menyatakan bahwa mereka digunakan untuk menyerap penyakit dan hal-hal negatif yang mempengaruhi manusia. Setelah itu, patung-patung tersebut dihancurkan atau dibuang, karena banyak patung dogu yang ditemukan di tumpukan sampah kuno. Banyak juga patung yang ditemukan, dengan bagian tubuh yang sengaja dihilangkan.
Periode Yayoi, yang dimulai sekitar tahun 300 SM, menandai berakhirnya pembuatan dan penggunaan patung dogu. “Hal ini menunjukkan adanya perubahan dalam sistem kepercayaan,” Beyer menambahkan.
Periode Jomon akhir juga terkenal karena gaya manik-manik yang lazim. Manik-manik melengkung berbentuk koma yang disebut magatama sangat populer pada masa ini.
Struktur perumahan juga berkembang selama Periode Jomon akhir. Dan pada akhir era ini, struktur tersebut telah berevolusi dari tempat tinggal berbentuk bulat menjadi rumah persegi atau persegi panjang. Lantai lumpur juga berevolusi melalui pengerasan jalan batu. Seperti rumah-rumah pada periode sebelumnya, rumah-rumah tersebut dilengkapi lubang api di dalam ruangan.
Salah satu ciri umum Periode Jomon adalah praktik ritual ablasi gigi. Sekitar 80% hingga 90% dari seluruh tengkorak yang ditemukan saat ini menunjukkan adanya gigi yang sengaja dicabut.
Sekitar tahun 1500 SM, iklim mulai mendingin dan populasi Jepang mulai berkurang. Kemungkinan penurunan sumber daya menyebabkan penurunan populasi secara keseluruhan. Pada tahun 300 SM, periode Jomon akhir dianggap telah berakhir, sementara beberapa sejarawan dan arkeolog berpendapat bahwa ini terjadi pada 1000 SM.
Berakhirnya Periode Jomon akhir ditandai dengan masuknya orang-orang dari Semenanjung Korea yang mulai bercampur dengan masyarakat Jomon setempat. Peristiwa ini menandai dimulainya Periode Yayoi dalam sejarah Jepang.