Keragu-raguan ini semakin memperburuk ketegangan internal kelompok tersebut, menyiapkan panggung untuk periode penuh gejolak berikutnya.
Mengapa Sinsengumi Berakhir?
Nasib Shinsengumi sangat terkait dengan Keshogunan yang mereka layani, sehingga kekuatan Keshogunan Tokugawa menyusut, begitu pula kekuatan dan pengaruh Shinsengumi.
Tahun 1868 menandai awal dari berakhirnya pasukan polisi samurai ini, karena Perang Boshin – perang saudara yang terjadi antara pasukan pro-kekaisaran dan pro-shogun – menandakan lonceng kematian bagi Keshogunan dan, selanjutnya, Shinsengumi.
Dengan dimulainya Perang Boshin, Shinsengumi mendapati diri mereka berada di pihak yang kalah dalam sejarah.
Mereka bertempur dengan gagah berani bersama sisa-sisa pasukan Keshogunan, berpartisipasi dalam pertempuran penting seperti Pertempuran Toba-Fushimi.
Terlepas dari upaya mereka, pasukan pro-kekaisaran terbukti terlalu kuat, dan pasukan Keshogunan, termasuk Shinsengumi, terpaksa mundur.
Pemimpin mereka, Kondō Isami, ditangkap dalam Pertempuran Kōshū-Katsunuma dan kemudian dieksekusi oleh pemerintahan Meiji yang baru.
Hilangnya Kondō merupakan pukulan telak bagi Shinsengumi yang sudah terkepung, baik dari segi moral maupun kepemimpinan.
Setelah eksekusi Kondō, anggota Shinsengumi yang tersisa, di bawah pimpinan Hijikata Toshizō, mundur ke utara menuju Aizu.
Di sana, mereka berkumpul kembali dan melanjutkan pertarungan, mengambil bagian dalam Pertempuran Aizu. Setelah serangkaian pertempuran yang melelahkan, mereka kembali mundur lebih jauh ke utara ke pulau Hokkaido.
Hijikata mengorganisir anggota yang tersisa ke dalam kelompok baru yang disebut Republik Ezo, berusaha untuk membangun domain independen di Hokkaido dengan pasukan Shogun yang masih hidup.
Kelompok itu membuat pertahanan terakhirnya melawan pasukan kekaisaran di Pertempuran Hakodate. Namun, perlawanan mereka sia-sia. Hijikata kalah dalam pertempuran, dan Republik Ezo dengan cepat dibubarkan setelah kekalahan mereka.
Dengan jatuhnya Hijikata dan pembubaran Republik Ezo, Shinsengumi secara resmi tidak ada lagi.